教員情報 - 津下　英明

研究概要

業績

学会発表

著書・論文歴

経歴

学歴

職歴

研究キーワード：構造生物学、生物物理学、細菌毒素、ADPリボシル化、細菌、毒素、ウィルスの細胞侵入機構、カテプシン阻害剤、ディフィシル菌二成分毒素CDT、ウェルシュ菌イオタ毒素、クライオ電子顕微鏡単粒子解析、X線結晶構造解析、タンパク質膜透過機構、ADPリボシル化、細菌、毒素、ウィルスの細胞侵入機構、カテプシン阻害剤、ディフィシル菌二成分毒素CDT、ウェルシュ菌イオタ毒素、クライオ電子顕微鏡単粒子解析、X線結晶構造解析、タンパク質膜透過機構、ADPリボシル化、細菌、毒素、ウィルスの細胞侵入機構、カテプシン阻害剤、ディフィシル菌二成分毒素CDT、ウェルシュ菌イオタ毒素、クライオ電子顕微鏡単粒子解析、X線結晶構造解析、タンパク質膜透過機構、ADPリボシル化

（最終更新日：1000-01-01 00:00:00）

  ツゲ　ヒデアキ   TSUGE HIDEAKI
  津下　英明
   所属   京都産業大学生命科学部先端生命科学科

職種教授

研究概要

■ 研究概要

◆研究課題二成分毒素の複合体の構造と機能の解明 ◆研究概要ウェルシュ菌E型の産出するイオタ毒素は二成分毒素であり, A成分とB成分からなる. A成分であるIaはアクチンを特異的にADPリボシル化する酵素（毒素）であり, B成分であるIbはIaをエンドサイトーシス経由で細胞内に送り込むタンパク質膜透過の装置と考えられている. これに似た二成分毒素はデフィシル菌CDT(CDTa, CDTb)が知られる。 Ib膜孔とIa-Ib膜孔複合体の構造を,Cryo-EMでの構造決定を行ない,高い分解能で明らかにしている（Nature Structural & Molecular Biology:2020）。Ib膜孔はIbが７つ集まって膜孔を形成し,さらに１つのIaが結合している。これは,Iaが膜透過する直前の構造を見たと考えている。さらに2021,2022年度,デフィシル菌CDT(CDTa, CDTb)の複合体の構造を明らかにし報告をした（Nature Communications: 2022)。この新たなタンパク質透過システムを「トキシン透過システム」と命名した。しかしながら,タンパク質の膜透過機構については,まだまだ不明な点が多い。構造で明らかにしたことは,CDTaの結合によりN末端のαヘリックスが解ける様子であるが,今後は,透過のさらなる様子をCryo-EMを使用して明らかにしていく。また二成分毒素の細胞への影響を見ていく,電気生理実験の系を立ち上げて,in vitroでの膜孔形成を追っていくなど,新たな実験も進めたい。また,挑戦的課題である,リポソームを用いたIb膜孔の調整を行い、この過程でできたIb-rosettaと命名した新たな構造体でCryo-EM解析を行なった。ここから,膜孔が形成される過程をstep-by-stepで捉えて解析を行なっている。この他にも,ジャンボタニシが持つ,膜孔形成毒素(パーフォリン)に焦点を当て,Cryo-EMによる解析で構造を明らかにしたと考えている。

業績

■ 学会発表

1.		アクチン特異的ADPリボシル化毒素CPILEの構造と構造に基づく変異体解析（ETOX18 (European Workshop on Bacterial Protein Toxins)）
2.	2023/11	Construction of a membrane translocation assay system for C. difficile binary toxin　by electrophysiological technique（日本生物物理学会）
3.	2023/09	クライオ電子顕微鏡から見えてきたウェルシュ菌イオタ毒素の膜孔形成機構（第69回トキシンシンポジウム）
4.	2023/09	二成分毒素CPILEbのセリンで形成された膜貫通孔（第69回トキシンシンポジウム）
5.	2023/07	ウェルシュ菌イオタ毒素Ib　serine-clamp変異体の単粒子構造解析及び活性測定（蛋白質科学会）
6.	2023/06	二成分毒素：ADPリボシル化酵素成分の基質認識機構と細胞膜透過機構について（日本環境変異原ゲノム学会　シンポジウム「有毒生物と遺伝子変異」）
7.	2023/06	細菌ADPリボシル化酵素の基質認識機構とその細胞膜透過に関する研究（日本ビタミン学会）
8.	2020/12/10	見えてきたタンパク質膜透過機構、クロストリジウム二成分毒素複合体の単粒子解析から（第46回生体エネルギー研究会）
9.	2020/08/29	二成分毒素複合体のクライオ電子顕微鏡による構造解析：ADPリボシル化毒素の細胞内輸送機構の解明（第460回ビタミンB 研究協議会）
10.	2020	二成分毒素膜孔複合体の単粒子解析（第76回顕微鏡学会）
11.	2019/08/30	タンパク質膜透過チャネルの単粒子構造解析（第457回ビタミンB 研究協議会）
12.	2019/06/25	クライオ電子顕微鏡によるクロストリジウム二成分毒素タンパク質透過チャンネルの構造（European Workshops on Bacterial Protein Toxins – ETOX19）
13.	2019	DNAを基質とするADPリボシル基転移酵素の基質認識機構（酵素補酵素研究会2019）
14.	2019	DNAを標的としたADPリボシル化酵素の基質認識機構（International Symposium on “Proteins; from the Cradle to the Grave”）
15.	2019	ウェルシュ菌２成分毒素膜孔複合体の単粒子解析（生理研研究会,クライオ電子顕微鏡によるタンパク質の高分解能単粒子構造解析）
16.	2019	クライオ電子顕微鏡によるクロストリジウム二成分毒素タンパク質膜透過チャンネルの構造（第57回日本生物物理学会）
17.	2019	新たに見つかったウェルシュ菌エンテロトキシンCPILEの下痢原性（CLOSPATH 11）
18.	2019	病原菌由来モノADPリボシル基転移酵素の基質認識機構に関する研究（酵素補酵素研究会2019）
19.	2018/08/30	DNAを標的としたADPリボシル化酵素の基質認識機構（第453回ビタミンB 研究協議会）
20.	2018/02/25	Clostridium Binary Toxin：膜孔形成タンパク質トロンスロコンの作用機構について（京都薬科大学講演会）
21.	2018	ウェルシュ菌二成分毒素イオタ毒素の膜透過とADPリボシル化機構（International Symposium on “Proteins; from the Cradle to the Grave”）
22.	2018	ウェルシュ菌２成分毒素のクライオ電子顕微鏡単粒子解析（International Symposium on “Proteins; from the Cradle to the Grave”）
23.	2018	細菌由来C3毒素とRhoA複合体構造から明らかになったADP-リボシル化酵素の基質特異性（第70回ビタミン学会）
24.	2017/10/28	ウェルシュ菌の食中毒に関わる新規ADPリボシル化毒素CPILE： Iota毒素との比較（第450回ビタミンB研究協議会）
25.	2017/03/04	ヒトADPリボシル化酵素(PARP)と細菌モノADPリボシル化毒素との構造と機能の比較（第447回ビタミンB研究協議会）
26.	2017	アクチン特異的ADPリボシル化毒素CPILEの構造と構造に基づく変異体解析（ETOX18 (European Workshop on Bacterial Protein Toxins)）
27.	2017	プロペプチド欠損セリンプロテアーぜの外部シャペロンの機能を理解するための構造基礎（ETOX18 (European Workshop on Bacterial Protein Toxins)）
28.	2016/07/22	細菌由来ADPリボシル化毒素の作用機構と基質特異性（大阪府立大学獣医学専攻オープンセミナー）
29.	2016	C3 exoenzymeとRhoA複合体の結晶構造解析に基づく基質特異性（第39回日本分子生物学会年会）
30.	2016	C3外毒素によるRhoAのADPリボシル化（ICC05-AEM2016）
31.	2016	ウェルシュ菌CPILEの特徴を明らかにする（ICC05-AEM2016）
32.	2016	ウェルシュ菌産生イオタ毒素Ib成分のオリゴマーの調整（第89回日本生化学会大会）
33.	2015	ADPリボシル化酵素C3とRhoA複合体の構造とその認識機構（第441回ビタミンB研究協議会、ホテルコスモスクエア国際交流センター（大阪））
34.	2015	Aeromonas sobria由来プロペプチド欠損プロテアーゼの外部シャペロンによるフォールディング機構（日本生化学会、神戸ポートアイランド(神戸)）
35.	2015	DNAライブラリーから発現量の多い可用性領域を迅速に選択する手法の開発（日本生化学会、神戸ポートアイランド(神戸)）
36.	2015	Structural basis of ADP-ribosyltransferase C3 exoenzyme with RhoA complex（第53回日本生物物理学会、金沢大学（金沢））
37.	2015	Structural basis of Bacterial ADP-ribosyltransferase and Human Protein Complex（ETOX17(European Workshop on Bacterial Protein Toxins) (Braga)）
38.	2015	ラン藻アナベナ由来 12量体グルタミン合成酵素の結晶構造（第53回日本生物物理学会、金沢大学（金沢））
39.	2014	ADPリボシル化RhoAの構造とそのシグナル伝達への影響（日本生化学会、京都国際会館(京都)）
40.	2014	ADPリボシル化RhoAの立体構造に基づく阻害機構（ビタミンB研究協議会、大阪工業大学うめきたナレッジセンター（大阪））
41.	2014	Dye-decolorizing peroxiadseの触媒サイクルと基質結合部位（第61回日本生化学会近畿支部年会）
42.	2014	Visualization of actin mono-ADP-ribosylation in iota toxin and actin complex structure.（ASBMB annual meeting (SanDiego),）
43.	2014	ウェルシュ菌毒素IaによるactinのADPリボシル化機構（第61回日本生化学会近畿支部年会）
44.	2014	タンパク質の構造の見方・使い方：細菌毒素による翻訳後修飾の構造生物学（徳島大学薬学部大学院特論（徳島大学））
45.	2014	細菌感染症因子とホストタンパク質複合体の構造生物学（第７回共同利用・共同研究「酵素学研究拠点」シンポジウム勝沼信彦名誉教授追悼記念講演会、徳島大学疾患酵素学研究センター（徳島））
46.	2013/11/02	インフルエンザウィルスRNAポリメラーゼCAP結合とその構造（第434回ビタミンB研究協議会）
47.	2013/07/31	結晶構造から明らかにしたモノグリセロールリパーゼの基質特異性（The 7th International Conference on Structural Genomics）
48.	2013	Ia-actin 複合体結晶場におけるADPリボシル化の捕捉（第13回日本蛋白質科学会年会）
49.	2013	病原菌をさらに理解するための構造生物学（第86回細菌学会総会）
50.	2012/12/06	創薬標的であるインフルエンザウィルスRNAポリメラーゼの構造研究（イノベーションフェア関西）
51.	2012/11/17	アルギニンADPリボシル化初めての可視化（第430回ビタミンB研究協議会）
52.	2012/09/13	ウェルシュ菌イオタ毒素のアクチンの認識とADPリボシル化（The 11th Awaji International Forum on Infection and Immunity）
53.	2012/02/04	ADPリボシル化反応に伴う酵素の構造変化（第427回ビタミンB研究協議会）
54.	2012	A型インフルエンザウィルスRNAポリメラーゼPB2の構造と機能（第85回日本生化学会大会）
55.	2012	アクチンADPリボシル化反応に伴う酵素の構造変化（第12回日本蛋白質科学会年会）
56.	2012	モノアシルグリセロールリパーゼの二量体形成はその機能に重要か？（第85回日本生化学会大会）
57.	2011/12/22	ADPリボシル化毒素構造研究の最前線（シンポジウム「疾患治療に用いる天然有機化合物の生合成遺伝子の包括的理解」、徳島文理大学（徳島））
58.	2011/11/27	高度好熱菌HB8由来のフラビン還元酵素の構造機能解析（第422回研究ビタミンB協議会）
59.	2011/09/10	感染症因子とヒトタンパク質の相互作用を見る（X線の会）
60.	2011	ADPリボシル化毒素によるアクチン認識の特異性解析（第11回日本蛋白質科学会年会）
61.	2011	アクチンADPリボシル化の構造基盤（第84会日本生化学会大会シンポジウム「ADPリボシル化によるシグナル伝達制御」）
62.	2011	ヘリコバクターピロリ由来TNAα誘導タンパク質の構造基盤（22nd IUCR Congress (International Union of Crystallography),）
63.	2011	新たなリガンドを入れたイオタ毒素とアクチン複合体の結晶構造（22nd IUCR Congress (International Union of Crystallography)）
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■ 著書・論文歴

1.	2024/07	論文	General ADP-Ribosylation Mechanism Based on the Structure of ADP-Ribosyltransferase-Substrate Complexes. Toxins 16(7) （共著）
2.	2024/05	論文	Structural Elucidation and Antiviral Activity of Covalent Cathepsin L Inhibitors. Journal of medicinal chemistry 67(9),7048-7067頁（共著）
3.	2022/10	論文	Cryo-EM structures of the translocational binary toxin complex CDTa-bound CDTb-pore from Clostridioides difficile Nature Communications （共著）
4.	2021/01	論文	Common Mechanism for Target Specificity of Protein- and DNA-Targeting ADP-Ribosyltransferases Toxins 13(1),40-40頁（共著）
5.	2021	論文	Preparation of Clostridium perfringens binary iota-toxin pore complex for structural analysis using cryo-EM. Methods in enzymology 649,pp.125-148
6.	2020/06/26	論文	A myelin sheath protein forming its lattice Journal of Biological Chemistry 295(26),8706-8707頁
7.	2020/03	論文	Cryo-EM structures reveal translocational unfolding in the clostridial binary iota toxin complex Nature Structural & Molecular Biology 27(3),pp.288-296 （共著）
8.	2018/09/07	論文	Substrate N2 atom recognition mechanism in pierisin family DNA-targeting, guanine-specific ADP-ribosyltransferase ScARP Journal of Biological Chemistry
9.	2018/02	その他	Aeromonas sobriaセリンプロテアーゼの基質認識におけるArg-566の関与(Involvement of the Arg-566 residue of Aeromonas sobria serine protease in substrate specificity) 日本細菌学雑誌 73(1),pp.108-108
10.	2017/10/12	論文	Involvement of the Arg566 residue of Aeromonas sobria serine protease in substrate specificity PLoS One 12(10)
11.	2017/02/15	論文	Crystal structure and structure-based mutagenesis of actin-specific ADP-ribosylating toxin CPILE-a as novel enterotoxin PLOS ONE 12(2)
12.	2016/08	論文	Comparative Studies of Actin- and Rho-Specific ADP-Ribosylating Toxins: Insight from Structural Biology. Curr Top Microbiol Immunol.- The actin Cytoskeleton and Bacterial Infection 99,69-86頁
13.	2016/01	論文	Anabaena sp. DyP-type peroxidase is a tetramer consisting of two asymmetric dimers. Proteins 84(1),pp.31-42
14.	2015/12	論文	Conformational plasticity is crucial for C3-RhoA complex formation by ARTT-loop. PATHOGENS AND DISEASE 73(9)
15.	2015/08/07	論文	Rho GTPase Recognition by C3 Exoenzyme Based on C3-RhoA Complex Structure Journal of Biological Chemistry 290(32),pp.19423-19432
16.	2015/03	論文	Structural Basis for Action of the External Chaperone for a Propeptide-deficient Serine Protease from Aeromonas sobria. The Journal of Biological Chemistry 290(17),pp.11130-11143
17.	2015	論文	Enteric toxins of Clostridium perfringens: Beta-toxin, tpeL, epsilon-toxin and iota-toxin. Molecular Medical Microbiology (Second edition) 2,pp.997-1013
18.	2015	論文	Reaction Mechanism of Mono-ADP-Ribosyltransferase Based on Structures of the Complex of Enzyme and Substrate Protein. Curr Top Microbiol Immunol.-ENDOGENOUS ADP-RIBOSYLATION 384(384),pp.69-87
19.	2015	その他	7. ADPリボシル化RhoAの立体構造に基づく阻害機構(第438回研究協議会研究発表要旨,ビタミンB研究委員会) ビタミン 89(3),153-154頁
20.	2014/09	論文	Substrate selectivity of bacterial monoacylglycerol lipase based on crystal structure. J Struct Funct Genomics. (15(3)),pp.83-9
21.	2014/09	その他	修飾酵素と基質タンパク質の反応前後における複合体結晶の作製と構造に基づく反応機構 : ウェルシュ菌イオタ毒素laによるアクチンの修飾機構放射光 : 日本放射光学会誌 27(5),233-240頁
22.	2014/01	論文	Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of a surface mutant of the middle domain of PB2 from human influenza A (H1N1) virus. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 70(70(Pt 1)),pp.72-75
23.	2013/03	論文	Arginine ADP-ribosylation mechanism based on structural snapshots of iota-toxin and actin complex. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 110(18),pp.7524-7524
24.	2013	論文	Conformational polymorphism of m7GTP in crystal structure of the PB2 middle domain from human influenza A virus. PLOS ONE 8(11)
25.	2012/09	論文	[The tertiary structures of the domains of influenza RNA polymerase]. Seikagaku 84(9),780-785頁
26.	2012	論文	Crystal structures of dye-decolorizing peroxidase with ascorbic acid and 2,6-dimethoxyphenol FEBS Letters 586(24),pp.4351-4356
27.	2012	論文	Role of side-edge site of sphingomyelinase from Bacillus cereus Biochemical and Biophysical Research Communications 422(1),pp.128-132
28.	2012	論文	Role of sphingomyelinase in infectious diseases caused by Bacillus cereus PLoS ONE 7(6)
29.	2011/12	論文	Structural Basis of Free Reduced Flavin Generation by Flavin Reductase from Thermus thermophilus HB8 JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 286(51),pp.44078-44085
30.	2011/11	論文	Structure and stability of Gyuba, a beta-lactoglobulin chimera PROTEIN SCIENCE 20(11),pp.1867-1875
31.	2011/07	論文	The catalytic mechanism of dye-decolorizing peroxidase DyP may require the swinging movement of an aspartic acid residue FEBS JOURNAL 278(13),pp.2387-2394
32.	2010/08	その他	【Helicobacter pyloriの遺伝子を用いた研究病原因子から分子疫学まで】Helicobacter pyloriのTipαによるヌクレオリンを介した発がん促進機構 Helicobacter Research 14(4),258-264頁
33.	2010/06	論文	Nucleolin as cell surface receptor for tumor necrosis factor-alpha inducing protein: a carcinogenic factor of Helicobacter pylori JOURNAL OF CANCER RESEARCH AND CLINICAL ONCOLOGY 136(6),pp.911-921
34.	2010	その他	Helicobacter pyloriの遺伝子を用いた研究:病原因子から分子疫学まで Helicobacter pyloriのTipαによるヌクレオリンを介した発がん促進機構 Helicobacter Research 14(4)
35.	2009/12	論文	The carboxy-terminal tail of Aeromonas sobria serine protease is associated with the chaperone MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY 53(12),pp.647-657
36.	2009/12	その他	Clostridium perfringens iota-toxin: structure and function. Toxins 1,208-228頁
37.	2009/11/25	その他	Correction to the article "non-native α-helix formation is not necessary for folding of lipocalin: Comparison of burst-phase folding between tear lipocalin and β-lactoglobulin" (Proteins: Structute, Function and Bioformatics (2009) 76, (226-236)) Proteins: Structure, Function and Bioinformatics 77,1015頁
38.	2009/10	論文	Refolding, characterization and crystal structure of (S)-malate dehydrogenase from the hyperthermophilic archaeon Aeropyrum pernix BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS 1794(10),pp.1496-1504
39.	2009/10	論文	Structural basis for the Helicobacter pylori-carcinogenic TNF-alpha-inducing protein BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 388(2),pp.193-198
40.	2009/10	論文	Structural Basis for the Kexin-like Serine Protease from Aeromonas sobria as Sepsis-causing Factor JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 284(40),pp.27655-27663
41.	2009/07	論文	Non-native alpha-helix formation is not necessary for folding of lipocalin: Comparison of burst-phase folding between tear lipocalin and beta-lactoglobulin PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS 76(1),pp.226-236
42.	2009/03	論文	Structural Basis of the Influenza A Virus RNA Polymerase PB2 RNA-binding Domain Containing the Pathogenicity-determinant Lysine 627 Residue JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 284(11),pp.6855-6860
43.	2009/02	論文	Crystallization and X-ray diffraction analysis of the RNA primer/promoter-binding domain of influenza A virus RNA-dependent RNA polymerase PB2 ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 65(65:),pp.144-146
44.	2009/01	論文	Structural analysis of human glutamine:fructose-6-phosphate amidotransferase, a key regulator in type 2 diabetes FEBS LETTERS 583(1),pp.163-167
45.	2009	その他	1SA3-02 Structural basis of the influenza A virus RNA polymerase PB2 RNA-binding domain containing the pathogenicitydeterminant lysine 627 residue(1SA3 Novel findings of influenza A virus RNA dependent RNA polymerase,The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan) Seibutsu Butsuri 49,pp.S5
46.	2009	その他	3P-004 Crystal structure of influenza virus RNA polymerase PB2 including host determinant residue K627(Protein:Structure,The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan) Seibutsu Butsuri 49,pp.S151
47.	2009	その他	超好熱性アーキアのフラビン含有アミノ酸脱水素酵素の機能と構造、及び応用日本応用酵素協会誌 43,33-44頁
48.	2008/06	論文	Structure of an archaeal alanine : glyoxylate aminotransferase ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 64(64(6):),pp.696-699
49.	2008/05	論文	Structural basis of actin recognition and arginine ADP-ribosylation by Clostridium perfringens L-toxin PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 105(21),pp.7399-7404
50.	2008/03	論文	Crystal structure of the YdjC-family protein TTHB029 from Thermus thermophilus HB8: Structural relationship with peptidoglycan N-acetylglucosamine deacetylase BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 367(3),pp.535-541
51.	2008/03	論文	Structure of L-aspartate oxidase from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS 1784(3),pp.563-571
52.	2007/11	論文	Sequential aldol condensation catalyzed by hyperthermophilic 2-deoxy-D-ribose-5-phosphate aldolase APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 73(22),pp.7427-7434
53.	2007/08	論文	Crystal structure of archaeal highly thermostable L-aspartate dehydrogenase/NAD/citrate ternary complex FEBS JOURNAL 274(16),pp.4315-4325
54.	2007/04	論文	Structural basis of D-DOPA oxidation by D-amino acid oxidase: Alternative pathway for dopamine biosynthesis BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 355(2),pp.385-391
55.	2007/01	論文	Structure of a hyperthermophilic archaeal homing endonuclease, I-Tsp061I: Contribution of cross-domain polar networks to thermostability JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 365(2),pp.362-378
56.	2007	論文	Human D-amino acid oxidase: an update and review CHEMICAL RECORD 7(5),pp.305-315
57.	2007	その他	1P030 Molecular Mechanism of Actin Recognition by Arginine ADP-ribosylating Toxin(Proteins-functions, methodology, and protein enigineering,Oral Presentations) Seibutsu Butsuri 47,pp.S31
58.	2006/12	論文	Crystal structure of human D-amino acid oxidase: Context-dependent variability of the backbone conformation of the VAAGL hydrophobic stretch located at the si-face of the flavin ring PROTEIN SCIENCE 15(12),pp.2708-2717
59.	2006/06	論文	Structural basis of the sphingomyelin phosphodiesterase activity in neutral sphingomyelinase from Bacillus cereus JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 281(23),pp.16157-16167
60.	2006/01/01	その他	Novel diflavin-containing dehydrogenase family: FAD, FMN and ATP-containing L-proline dehydrogenase Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society. 78,41-45頁
61.	2006	その他	超好熱菌タンパク質の耐熱化の分子戦略化学と生物 44(5),305-312頁
62.	2005/09	論文	Crystal structure of a novel FAD-, FMN-, and ATP-containing L-proline dehydrogenase complex from Pyrococcus horikoshii JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 280(35),pp.31045-31049
63.	2005/08	論文	A second novel dye-linked L-proline dehydrogenase complex is present in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT-3 FEBS JOURNAL 272(16),pp.4044-4054
64.	2005/07	その他	Crystal structure of the NAD biosynthetic enzyme quinolinate synthase JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 280(29),pp.26645-26648
65.	2005/03/25	その他	超好熱菌由来アルドラーゼのユニークな4次構造と高度耐熱性生物物理 45(2),97-100頁
66.	2005/01	論文	The first crystal structure of hyperthermostable NAD-dependent glutamate dehydrogenase from Pyrobaculum islandicum JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 345(2),pp.325-337
67.	2005	その他	1P019 Aeromonas sobria由来セリンプロテアーゼのX線結晶構造解析(蛋白質 A) 構造)) 生物物理 45,S36頁
68.	2005	その他	1P045 超好熱アーキアP. aerophilum由来2-Deoxyribose-5-PhosphateAldolaseのX線結晶構造解析(蛋白質 B) 構造・機能相関)) 生物物理 45,S43頁
69.	2005	その他	1P107 (Pro)caspase-3のアクティベーター及び阻害剤との複合体の探索(蛋白質 D) 機能(反応機構、生物活性など))) 生物物理 45,S58頁
70.	2005	その他	1SE53 相互作用解析のための複合体サンプルの調整(インタラクトーム構造生物学の展開に向けて) 生物物理 45,S16頁
71.	2005	その他	2P014 Thermus thermophilus HB8由来タンパク質TTHA0420のX線結晶構造解析(蛋白質 A) 構造)) 生物物理 45,S123頁
72.	2005	その他	2P048 NAD生合成系酵素キノリン酸シンターゼの結晶構造(蛋白質 B) 構造・機能相関)) 生物物理 45,S131頁
73.	2005	その他	5.超好熱アーキアPyrococcus horikoshiiの新規プロリン脱水素酵素 : 補欠分子族の同定と立体構造解析(ビタミンB研究委員会第399回研究協議会研究発表要旨) ビタミン 79(3),184-185頁
74.	2005	その他	The first crystal structure of an archaeal helical repeat protein. Acta Cryst. F (61(7)),pp.636-639.
75.	2004/11	論文	Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of homing endonuclease I-Tsp061I ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 60(60(11)),pp.2006-2008
76.	2004/04/25	その他	2-III-15 超好熱アーキアPyrococcus horikoshii OT-3から発見されたフラビン酵素,色素依存性L-プロリン脱水素酵素の機能と構造(第56回大会一般研究発表) ビタミン 78(4),253-253頁
77.	2004/04	論文	Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the hyperthermostable NAD-dependent glutamate dehydrogenase from Pyrobaculum islandicum ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 60(60(4)),pp.715-717
78.	2004	論文	Amino-acid residues involved in the expression of the activity of Escherichia coli ToIC MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY 48(10),pp.713-722
79.	2004	その他	2P010 P. horikoshii由来L-プロリン脱水素酵素のX線結晶構造解析(蛋白質 A) 構造) 生物物理 44,S112頁
80.	2004	その他	2P013 H.pyloriから分泌される新規分泌TNF-α誘導タンパク質(Tip)のX線結晶構造解析(蛋白質 A) 構造) 生物物理 44,S113頁
81.	2004	その他	3P050 大腸菌で生産されるPyrobaculum islandicum由来のグルタミン酸脱水素酵素の活性化機構(蛋白質 C) 物性 : 安定性、折れたたみなど) 生物物理 44,S202頁
82.	2003/03	論文	The first crystal structure of archaeal aldolase - Unique tetrameric structure of 2-deoxy-D-ribose-5-phosphate aldolase from the hyperthermophilic archaea Aeropyrum pernix JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 278(12),pp.10799-10806
83.	2003/01	論文	Crystal structure and site-directed mutagenesis of enzymatic components from Clostridium perfringens iota-toxin JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 325(3),pp.471-483
84.	2003	論文	Clostridium perfringens iota-toxin, ADP-ribosyltransferase: structure and mechanism of action ADVANCES IN ENZYME REGULATION, VOL 43 43,pp.361-377
85.	2003	その他	1A16-2 Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of L-aspartate oxidase from the hyperthermophilic archaeon, Pyrococcus furiosus : 日本生物工学会大会講演要旨集 15,pp.48-48
86.	2002/12	論文	Chondroitin sulfate proteoglycan is a potent enhancer in the processing of procathepsin L BIOLOGICAL CHEMISTRY 383(12),pp.1925-1929
87.	2002/10	論文	Crystal structure of the ADP-dependent glucokinase from Pyrococcus horikoshii at 2.0-angstrom resolution: A large conformational change in ADP-dependent glucokinase PROTEIN SCIENCE 11(10),pp.2456-2463
88.	2002/08	論文	Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of glutamate dehydrogenase from an aerobic hyperthermophilic archaeon, Aeropyrum pernix K1 ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 58,pp.1338-1339
89.	2002/07	論文	Crystallization and preliminary X-ray crystallographic studies of monoacylglycerol lipase of the moderately thermophilic Bacillus sp H-257 ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 58,pp.1232-1233
90.	2002/01	論文	Structure-based design of specific cathepsin inhibitors and their application to protection of bone metastases of cancer cells ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS 397(2),pp.305-311
91.	2002	論文	Structure-based development of cathepsin L inhibitors and therapeutic applications for prevention of cancer metastasis and cancer-induced osteoporosis ADVANCES IN ENZYME REGULATION, VOL 42, PROCEEDINGS 42,pp.159-172
92.	2002	その他	3H1015 超好熱菌由来2-デオキシリボース-5-リン酸アルドラーゼのX線結晶構造解析(1.蛋白質(A)構造,一般講演,日本生物物理学会第40回年会) 生物物理 42(2),S168頁
93.	2001/04/25	その他	2-III-14 超好熱アーキアPyrococcus horikoshii OT-3のNAD生合成系の解明 : L-アスパラギン酸オキシダーゼの機能と構造ビタミン 75(4),243-243頁
94.	2001	その他	1P015超好熱古細菌P.furiosusのADP依存性グルコキナーゼの結晶構造生物物理 41,S36頁
95.	2000	その他	2C1545 Clostridium Perfringens Ia-アクチン特異的ADPリボシルトランスフェラーゼの結晶構造生物物理 40,S121頁
96.	2000	その他	カテプシンL選別的阻害剤のStructure Based Drug Design 法による開発生物工学 78巻10号 421-424/,
97.	1999/12	論文	Inhibition mechanism of cathepsin L-specific inhibitors based on the crystal structure of papain-CLIK148 complex BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 266(2),pp.411-416
98.	1999/09	論文	Structure based development of novel specific inhibitors for cathepsin L and cathepsin S in vitro and in vivo FEBS LETTERS 458(1),pp.6-10
99.	1999/08	その他	ヒト特異的細胞溶解毒素インターメディリシンとコレステロール結合性毒素の立体構造の比較生化学 71(8),1016-1016頁
100.	1999/06	論文	Crystallization and preliminary X-ray studies of the Ia component of Clostridium perfringens iota toxin complexed with NADPH JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY 126(2),pp.175-177
101.	1996/09	論文	Structure of the human cytomegalovirus protease catalytic domain reveals a novel serine protease fold and catalytic triad CELL 86(5),pp.835-843
102.	1994/10	論文	X-RAY STRUCTURE OF A POKEWEED ANTIVIRAL PROTEIN, CODED BY A NEW GENOMIC CLONE, AT 0.23 NM RESOLUTION - A MODEL STRUCTURE PROVIDES A SUITABLE ELECTROSTATIC-FIELD FOR SUBSTRATE-BINDING EUROPEAN JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 225(1),pp.369-374
103.	1994	その他	Crystallization and preliminary-x-ray crystallographic studies of recombinant human Leukotriene A4 hydrolase complexed with bestatin. Journal of Molecular Biology 238(5),pp.854-856
104.	1993/04	論文	NUCLEOTIDE-SEQUENCE OF A GENOMIC GENE ENCODING TRITIN, A RIBOSOME-INACTIVATING PROTEIN FROM TRITICUM-AESTIVUM PLANT MOLECULAR BIOLOGY 22(1),pp.171-176
105.	1992/07	論文	CRYSTALLIZATION AND PRELIMINARY-X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF MIRABILIS ANTIVIRAL PROTEIN JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 226(1),pp.281-283
106.	1992/02	論文	CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF A CALCIUM-BINDING LYSOZYME FROM EQUINE MILK AT 2.5 A RESOLUTION JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 111(2),pp.141-143
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経歴

■ 学歴

1.	(学位取得)	Hokkaido University Doctor of Science
2.	(学位取得)	Hokkaido University Doctor of Science
3.	1987/04～1989/03	北海道大学理学研究科高分子学科
4.	～1987	北海道大学理学部理学高分子

■ 職歴

1.		京都産業大学総合生命科学部生命資源環境学科
2.	2018/04～	京都産業大学感染症分子研究センター
3.	2018/04～	京都産業大学感染症分子研究センター
4.	2016/04～	京都産業大学タンパク質動態研究所
5.	2016/04～	京都産業大学タンパク質動態研究所
6.	2010/04～2019/03	京都産業大学総合生命科学部生命資源環境学科教授
7.	2010/04～	京都産業大学生命科学部先端生命科学科（旧総合生命科学部生命資源環境学科）教授
8.	2010/04～	京都産業大学生命科学部先端生命科学科（旧総合生命科学部生命資源環境学科）教授
9.	2003/04～2009/03	徳島大学分子酵素学研究センター
10.	2002/04～2010/03	徳島文理大学健康科学研究所兼人間生活学部（旧家政学部）
11.	1997/06～2002/03	徳島文理大学健康科学研究所兼家政学部
12.	1994～1997	アグロン製薬（現ファイザーサンディエゴ）
13.	1989～1994	日本たばこ産業生命科学研究所
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■ 主要学科目

化学通論B、生体分子構造学、生体分子機能学、タンパク質科学

■ 所属学会

1.		日本ビタミン学会
2.		日本分子生物学会
3.		日本生化学会
4.		日本生物物理学会
5.		日本結晶学会
6.		日本蛋白質科学会
7.		毒素シンポジウム
8.	2014～	American Society for Biochemistry and Molecular Biology
9.	2014～	American Society for Biochemistry and Molecular Biology
10.	2013～	日本細菌学会
11.	2013～	日本細菌学会
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その他

■ 研究課題・受託研究・科研費

1.	2024/04～2027/03	セルロース高生産菌に見るエンカプスリンとカーゴタンパク質としてのDyPの役割とは基盤研究(C)
2.	2024/04～2027/03	リポソーム単粒子解析で迫るトキシン膜透過システムの理解基盤研究(B)
3.	2021/04～2024/03	クライオ電子顕微鏡によるタンパク質膜透過の動的構造解析基盤研究(B)
4.	2018/04～2021/03	クライオ電子顕微鏡とX線結晶構造解析による二成分毒素トランスロコンの構造機能解析基盤研究(C)
5.	2015/04～2018/03	ADPリボシル化酵素C3のRhoGTPase認識機構の解明基盤研究(C)
6.	2014/04～2016/03	ピロリ菌発がん因子Ｔｉｐαの構造と活性の相関若手研究(B)
7.	2014/04～2017/03	立体構造のトポロジーから紐解くDyP型ペルオキシダーゼの合理的改変基盤研究(C)
8.	2013/04～2015/03	複合体構造解析による細菌毒素の標的結合タンパク質認識機構の解明新学術領域研究(研究領域提案型)
9.	2013/04～2015/03	Target protein recognition by bacterial toxin based on complex structure analysis
10.	2012/04～2014/03	タンパク質分子のコロイド結晶化挑戦的萌芽研究
11.	2011/04～2013/03	複合体構造解析によるＡＤＰリボシル化毒素の標的タンパク質認識機構の解明新学術領域研究(研究領域提案型)
12.	2011/04～2013/03	複合体構造解析によるADPリボシル化毒素の標的タンパク質認識機構の解明
13.	2010～2012	新規ペルオキシダーゼファミリーを代表する酵素DyPの触媒メカニズムの解明基盤研究(C)
14.	2009～2011	モノADPリボシル化毒素と基質蛋白質複合体の結晶構造および反応機構の基盤解析基盤研究(C)
15.	2008/04	ビタミンB関連酵素の構造と機能研究
16.	2008/04	ビタミンB関連酵素の構造と機能研究
17.	2007～2008	スフィンゴミエリン代謝系酵素の構造および細胞生物学的な解析基盤研究(C)
18.	2005～2006	脂質ラフト理解のためのスフィンゴミエリン代謝系酵素のX線結晶構造解析基盤研究(C)
19.	2004～2005	ウエルシュ菌α毒素の毒素活性と酵素活性の関係に対する分子生物学的及び構造学的解析基盤研究(C)
20.	2004～2006	エンドヌクレアーゼの標的DNA認識に関する構造生物学的解析と基質特異性改変基盤研究(B)
21.	2003～2005	ヒト特異的細胞溶解毒素インターメディリシンの結晶構造と機能の解析基盤研究(C)
22.	2000～2000	リソゾーム由来の新カスパーゼ3活性化酵素と肝癌におけるこの欠如特定領域研究(C)
23.	1999～1999	蛋白立体構造に基づく6種カテプシン分別阻害剤開発とそれによる新生理機能の解明特定領域研究(A)
24.	1998～1998	ビタミンB_6による抗原プロセッシンダ酵素カテプシンBの阻害と免疫応答抑制特定領域研究(A)
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■ 委員会・協会等

1.		日本結晶学会編集委員
2.	2019/11～2021/10	日本生化学会代議員
3.	2014～	Journal of Biological Chemistry (JBC) Editorial Board Member
4.	2014～	Journal of Biological Chemistry (JBC) Editorial Board Member
5.	2014～	日本生化学会評議員
6.	2014～	日本生化学会評議員
7.	2014	第61回日本生化学近畿支部会実行委員
8.	2014	第61回日本生化学近畿支部会実行委員
9.	2009	第47回日本生物物理学会年会（徳島）実行委員
10.	2009	第47回日本生物物理学会年会（徳島）実行委員
11.	2008～	ビタミンB研究委員会委員
12.	2008～	ビタミンB研究委員会委員
13.	2006	日本生物物理学会地区編集委員
14.	2006	日本生物物理学会地区編集委員
15.	1997～2019	日本学術振興会第169委員会委員
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■ ホームページ

http://www.cc.kyoto-su.ac.jp/~tsuge/tsugelab/index.html

■ 受賞学術賞

2009

第45回徳島新聞科学賞 (感染症の構造生物学)

■ 現在の専門分野

医化学, 細菌学, 構造生物化学, 生物物理学, 医化学, 細菌学, 構造生物化学, 生物物理学, 生物物理学　（キーワード：構造生物学、生物物理学、細菌毒素、ADPリボシル化、細菌、毒素、ウィルスの細胞侵入機構、カテプシン阻害剤、ディフィシル菌二成分毒素CDT、ウェルシュ菌イオタ毒素、クライオ電子顕微鏡単粒子解析、X線結晶構造解析、タンパク質膜透過機構、ADPリボシル化、細菌、毒素、ウィルスの細胞侵入機構、カテプシン阻害剤、ディフィシル菌二成分毒素CDT、ウェルシュ菌イオタ毒素、クライオ電子顕微鏡単粒子解析、X線結晶構造解析、タンパク質膜透過機構、ADPリボシル化、細菌、毒素、ウィルスの細胞侵入機構、カテプシン阻害剤、ディフィシル菌二成分毒素CDT、ウェルシュ菌イオタ毒素、クライオ電子顕微鏡単粒子解析、X線結晶構造解析、タンパク質膜透過機構、ADPリボシル化）