教員情報 - 千葉　志信

研究概要

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学会発表

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学歴

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その他

研究課題・受託研究・科研費

現在の専門分野


研究キーワード：分子生物学,細胞生物学、細胞生物学、分子生物学、細胞生物学、分子生物学

（最終更新日：1000-01-01 00:00:00）

  チバ　シノブ   CHIBA SHINOBU
  千葉　志信
   所属   京都産業大学生命科学部先端生命科学科

職種教授

研究概要

■ 研究概要

◆研究課題新生タンパク質による翻訳制御の分子機構の解析 ◆研究概要　リボソームで新規に合成されたタンパク質は、リボソームのトンネルを通り、細胞質へと放出される。近年、新生タンパク質がリボソームに直接働きかけ、自身の翻訳伸長をフィードバック制御する例が報告されている。特に、新生鎖がリボソームの機能制御を介して細胞機能の調節に関わる例が報告された。当研究室では、当研究室で見出された枯草菌MifMや、その他の新規機能性新生鎖の分子機構を、遺伝学ならびに生化学的手法を用い、解明してきた。本年度も、前年度までの解析を継続することで、新生鎖の翻訳制御の普遍性や、その生理的意義についても明らかにする。とくに、バイオインフォマティクスの手法を用いて同定した新規機能性新生鎖の個別解析を遂行する．

業績

■ 学会発表

1.	2014	MifM研究から見えてきた翻訳伸長アレストの多様性（2013年度国立遺伝学研究所研究会「単細胞システムの細胞構築・運動・増殖機構の研究」）
2.	2014	YidCによるタンパク質膜組込機構（第61回生化学会近畿支部例会・京都）
3.	2014	YidCによるタンパク質膜組込機構の解明（第37回日本分子生物学会年会）
4.	2014	YidCによるチャネルに依存しない蛋白質膜組込機構（第87回日本生化学会大会）
5.	2014	チャネルに依存しない蛋白質膜組込機構：アレスト因子MifMを利用したYidCの機能解析（2014年度グラム陽性菌ゲノム機能会議）
6.	2014	働く新生鎖MifMを利用した蛋白質膜組込装置YidCの機能解析—Functional analysis of membrane protein insertase YidC using a regulatory nascent chain MifM.（第14回日本蛋白質科学会年会）
7.	2014	蛋白質局在化装置の活性をモニターする新生鎖（新学術領域「新生鎖の生物学」公開キックオフミーティング）
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■ 著書・論文歴

1.	2024/09	論文	Resolution of ribosomal stalling by EF-P and ABCF ATPases YfmR and YkpA/YbiT. Nucleic acids research 52(16),pp.9854-9866 （共著）
2.	2024/08	論文	A role for the S4-domain containing protein YlmH in ribosome-associated quality control in Bacillus subtilis. Nucleic acids research 52(14),pp.8483-8499 （共著）
3.	2024/04	論文	Patchy and widespread distribution of bacterial translation arrest peptides associated with the protein localization machinery. Nature communications 15(1),pp.2711 （共著）
4.	2024/03	論文	RAPP-containing arrest peptides induce translational stalling by short circuiting the ribosomal peptidyltransferase activity. Nature communications 15(1),pp.2432 （共著）
5.	2024/03	論文	The SecM arrest peptide traps a pre-peptide bond formation state of the ribosome. Nature communications 15(1),pp.2431 （共著）
6.	2023/12	論文	Znf598-mediated Rps10/eS10 ubiquitination contributes to the ribosome ubiquitination dynamics during zebrafish development. RNA (New York, N.Y.) 29(12),pp.1910-1927 （共著）
7.	2023/08	論文	Identification of Bacillus subtilis YidC Substrates Using a MifM-instructed Translation Arrest-based Reporter. Journal of molecular biology 435(15),pp.168172 （共著）
8.	2023/03	論文	Genome-encoded ABCF factors implicated in intrinsic antibiotic resistance in Gram-positive bacteria: VmlR2, Ard1 and CplR. Nucleic acids research （共著）
9.	2023/03	論文	Nascent chain-mediated translation regulation in bacteria: translation arrest and intrinsic ribosome destabilization. Journal of biochemistry 173(4),pp.227-236 （共著）
10.	2022/06	論文	Expression of Bacillus subtilis ABCF antibiotic resistance factor VmlR is regulated by RNA polymerase pausing, transcription attenuation, translation attenuation and (p)ppGpp. Nucleic acids research 50(11),pp.6174-6189 （共著）
11.	2021/02	論文	Search for translation arrest peptides encoded upstream of genes for components of protein localization pathways. Nucleic acids research 49(3),pp.1550-1566 （共著）
12.	2020/10	論文	Proteome-wide Capture of Co-translational Protein Dynamics in Bacillus subtilis Using TnDR, a Transposable Protein-Dynamics Reporter. Cell reports 33(2),pp.108250 （共著）
13.	2019/11	論文	Release factor-dependent ribosome rescue by BrfA in the Gram-positive bacterium Bacillus subtilis. Nature communications 10(1),pp.5397 （共著）
14.	2019/01	論文	Heat shock transcription factor σ32 defective in membrane transport can be suppressed by transposon insertion into genes encoding a restriction enzyme subunit or a putative autotransporter in Escherichia coli. Genes & genetic systems 93(6),pp.229-235 （共著）
15.	2019	論文	Sec translocon has an insertase-like function in addition to polypeptide conduction through the channel. F1000Research 8 （共著）
16.	2018/07	論文	MifM-instructed translation arrest involves nascent chain interactions with the exterior as well as the interior of the ribosome. Scientific reports 8(1),10311頁（共著）
17.	2018/06	論文	Monitoring substrate enables real-time regulation of a protein localization pathway. FEMS microbiology letters 365(11) （共著）
18.	2017/11	論文	Intrinsic Ribosome Destabilization Underlies Translation and Provides an Organism with a Strategy of Environmental Sensing. Molecular cell 68(3),pp.528-539.e5 （共著）
19.	2016/02	論文	Integrated in vivo and in vitro nascent chain profiling reveals widespread translational pausing. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 113(7),pp.E829-38 （共著）
20.	2015/10	論文	Nascent chain-monitored remodeling of the Sec machinery for salinity adaptation of marine bacteria. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 112(40),pp.E5513-22 （共著）
21.	2015	論文	Hydrophilic microenvironment required for the channel-independent insertase function of YidC protein. Proc Natl Acad Sci U S A. 112(16),pp.5063-8. （共著）
22.	2015	論文	MifM monitors total YidC activities of Bacillus subtilis, including that of YidC2, the target of regulation. J Bacteriol. 197(1),pp.99-107. （共著）
23.	2015	論文	Structure of the Bacillus subtilis 70S ribosome reveals the basis for species-specific stalling. Nat Commun. 6,pp.6941. （共著）
24.	2014	著書	Regulatory Nascent Polypeptides" Springer. （共著）
25.	2014	論文	Identification of a SecM segment required for export-coupled release from elongation arrest. FEBS Lett. 588(17),pp.3098-103. （共著）
26.	2014	論文	Structural basis of Sec-independent membrane protein insertion by YidC. Nature. 509(7501),pp.516-20. （共著）
27.	2013	論文	Arrest peptides: cis-acting modulators of translation. Annu Rev Biochem. 82,pp.171-202. （共著）
28.	2012	論文	Multisite ribosomal stalling: a unique mode of regulatory nascent chain action revealed for MifM. Mol Cell. 47(6),pp.863-72. （共著）
29.	2011	論文	Holin triggering in real time. Proc Natl Acad Sci U S A. 108(2),pp.798-803. （共著）
30.	2011	論文	Nascentome analysis uncovers futile protein synthesis in Escherichia coli. PLoS One. 6(12),pp.e28413. （共著）
31.	2011	論文	Post-liberation cleavage of signal peptides is catalyzed by the site-2 protease (S2P) in bacteria. Proc Natl Acad Sci U S A. 108(33),pp.13740-5. （共著）
32.	2011	論文	Recruitment of a species-specific translational arrest module to monitor different cellular processes. Proc Natl Acad Sci U S A. 108(15),pp.6073-8. （共著）
33.	2010	論文	Divergent stalling sequences sense and control cellular physiology. Biochem Biophys Res Commun. 393(1),pp.1-5. （共著）
34.	2009	論文	A ribosome-nascent chain sensor of membrane protein biogenesis in Bacillus subtilis. EMBO J. 28(22),pp.3461-75. （共著）
35.	2007/09	論文	Dual localization pathways for the engulfment proteins during Bacillus subtilis sporulation MOLECULAR MICROBIOLOGY 65(6),pp.1534-1546 （共著）
36.	2007/01	論文	Impact of membrane fusion and proteolysis on SpoIIQ dynamics and interaction with SpoIIIAH JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 282(4),pp.2576-2586 （共著）
37.	2006/04	論文	The Escherichia coli plasma membrane contains two PHB (prohibitin homology) domain protein complexes of opposite orientations MOLECULAR MICROBIOLOGY 60(2),pp.448-457 （共著）
38.	2005/10	論文	Engulfment-regulated proteolysis of SpoIIQ: evidence that dual checkpoints control sigma(K) activity MOLECULAR MICROBIOLOGY 58(1),pp.102-115 （共著）
39.	2002/09	論文	Membrane protein degradation,by FtsH can be initiated from either end JOURNAL OF BACTERIOLOGY 184(17),pp.4775-4782 （共著）
40.	2002	論文	The Cpx stress response system of Escherichia coli senses plasma membrane proteins and controls HtpX, a membrane protease with a cytosolic active site. Genes Cells. 7(7),pp.653-62. （共著）
41.	2000	論文	Length recognition at the N-terminal tail for the initiation of FtsH-mediated proteolysis EMBO Reports 1/1,47 （共著）
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経歴

■ 学歴

1.	(学位取得)	博士（京都大学）博士（理学）
2.	～2002	京都大学大学院理学研究科化学専攻
3.	～1999	北海道大学
4.	～1997	北海道大学薬学部

■ 職歴

1.		京都産業大学総合生命科学部生命システム学科京都産業大学総合生命科学部
2.	2019/04～	京都産業大学生命科学部先端生命科学科教授
3.	2014/04～2019/03	京都産業大学総合生命科学部生命システム学科准教授

その他

■ 研究課題・受託研究・科研費

1.		Study on the proteolysis of Membrane protein.
2.	1999	タンパク質合成、成熟、局在化、品質管理に関する研究

■ 現在の専門分野

分子生物学, 細胞生物学, 細胞生物学, 分子生物学, 構造生物化学, 細胞生物学, 分子生物学, 構造生物化学　（キーワード：分子生物学,細胞生物学、細胞生物学、分子生物学、細胞生物学、分子生物学）